UROLOGIE

E-coli (UPEC) fait partie des uropathogènes les plus fréquemment en cause au cours des infections urinaires. Ces bactéries sont retrouvées dans l’urobiome d’hommes et de femmes asymptomatiques et, bien entendu chez des sujets symptomatiques. Ces E. coli urinaires appartiennent majoritairement à un groupe phylogénique particulier (phylogroupe B2) moins abondant dans l’intestin que d’autres groupes phylogéniques. Ce groupe phylogénique d’E. coli serait donc plus apte à coloniser la niche vésicale que d’autres groupes phylogéniques.

Un lien existe entre diverses pathologies vésicales (hyperactivité vésicale, cystite interstitielle, prostatite chronique, douleurs pelviennes chroniques…) et syndrome du côlon irritable ainsi que stress chronique. Au-delà de l’intestin, il existe bien un axe complexe bidirectionnel vessie-intestin-cerveau.

Plusieurs mécanismes peuvent être en cause :
• Translocation bactérienne soit par voie périnéale en raison de la proximité anatomique de l’anus et du méat urinaire chez la femme, soit par voie systémique en cas de perméabilité de la paroi intestinale
• Translocation systémique de métabolites bactériens : acides gras à chaîne courte, cytokines pro-inflammatoires et métabolites agissant sur l’immunité …

Il ne faut pas ignorer également des modifications de l’environnement urétro-vésical qui pourraient favoriser la croissance et l’agressivité d’uro-pathogènes. Chez la femme, le microbiome vaginal joue un rôle dans la colonisation vésicale par des uro-pathogènes : en cas de dysbiose vaginale, le microbiome vaginal ne joue plus son rôle de « sas » entre le rectum et la vessie facilitant ainsi l’ascension bactérienne via l’urètre. Il a même été démontré que des traitements de colite pseudomembraneuses par transplantation de microbiote fécal pouvait réduire certaines infections urinaires.

Les infections urinaires (IU) sont 8 fois plus fréquentes chez la femme que chez l’homme.

➔ Chez la femme, on distingue la cystite simple non compliquée de la cystite à risque de complication (sur terrain favorisant comme la grossesse, des pathologies associées ou l’âge…) et de la cystite récidivante (plus de 4 épisodes par an). Les bactéries les plus souvent en cause sont majoritairement les souches d’Escherichia coli uropathogènes (UPEC) suivies par Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus saprophyticus, Enteroccus faecalis et Proteus mirabilis (cf Fig 3).
La prise en charge de ces infections récidivantes doit tenir compte du risque de dsybiose intestinale et/ou vaginale.

➔ Chez l’homme, l’urobiome est également impliqué dans les prostatites chroniques et les douleurs pelviennes chroniques. Ces pathologies impliqueraient aussi le microbiote séminal avec, en particulier, une diminution de la concentration en lactobacilles.

➔ Urobiome et incontinence urinaire
L’incontinence urinaire féminine (IUF) (perte involontaire des urines en dehors des mictions) touche environ 30 % des femmes et augmente avec l’âge. Plusieurs causes sont identifiées : hypermobilité urétrale, altération du sphincter urinaire, hyperactivité et hyper sensibilité vésicales…Des modifications des microbiotes urinaire et vaginal ont également été associées  à l’IUF chez les femmes en post-partum et chez les femmes ménopausées avec une diminution des lactobacilles et une augmentation de la concentration de bactéries associées à la vaginose. Cependant, si la dysbiose urinaire et/ou vaginale est avérée chez les femmes avec IUF, les résultats sont parfois discordants au niveau des genres bactériens selon les études.

➔ Microbiomes et calculs urinaires
La majorité des calculs urinaires est constituée d’oxalates de calcium, plus rarement d’acide urique. Le microbiote intestinal et l’urobiome montrent des modifications dans leur composition entre sujets lithiasiques et témoins : augmentation des bactéries du genre Bacteroides et diminution des bactéries du genre Prevotella dans l’intestin des sujets lithiasiques (cf Fig 4).

Une autre étude a montré la présence plus abondante de bactéries productrices d’acides gras à chaîne courte (Blautia, Anaerostipes, Coprociccus, Fusobacterium…) chez les sujets sains par rapports aux sujets lithiasiques. Or certains de ces acides (acétate, pyruvate, butyrate) ont  montré une action anti-oxalate rénale chez l’animal.

Le microbiote intestinal pourrait également intervenir via sa propriété de métaboliser les hormones sexuelles. En effet les androgènes favorisent la formation de lithiases d’oxalate alors que les oestrogènes diminuent le risque.

Dans les urines, plusieurs bactéries (Proteus mirabilis, Klebsiella pneumonia, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Providentia stuartii, Serratia…) sont productrices d’uréase qui alcalinise les urines et favorise la formation de cristaux urinaires.

➔ Urobiome et cancers uro-génitaux
• Cancer prostatique : les mécanismes du lien entre microbiomes et cancer de la prostate sont encore imprécis mais il a été observé une implication de plusieurs microbiotes (intestinal, génito-urinaire et prostatique) dans le cancer prostatique (cf Fig 5). Par ailleurs, le lien démontré entre obésité et cancer de la prostate est en faveur d’un rapport entre dysbiose intestinale et cancer prostatique.

• Cancer de la vessie : l’hétérogénicité des études sur microbiomes et cancer de la vessie rend difficile toute conclusion robuste sur l’implication de telle ou telle bactérie dans la survenue de ce cancer. La figure 6 résume les données actuelles.

• Cancer du rein : la concentration intestinale de Ruminococcustorques et de Erysipelatoclostridium  pourrait être liée à une augmentation du risque de cancer du rein. Plusieurs mécanismes physiopathologiques sont évoqués pour expliquer le rapport entre dysbiose intestinale et carcinome rénal :
– Action directe de bactéries pathogènes qui créent une inflammation tissulaire avec sécrétion de dérivés réactifs en oxygène (radicaux libres, peroxydes…) qui favorisent la carcinogénèse
– Action indirecte de bactéries qui limitent les réactions immunitaires susceptibles de bloquer la prolifération tumorale
– Production par des bactéries pathogènes et passage systémique de métabolites microbiens avec altération des barrières cellulaires